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更新于 2026-10-17

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蛋白质的接触序是蛋白质天然状态三级结构中氨基酸间接触位置的量度。它计算方法为折叠蛋白质中形成天然接触的残基之间的平均序列距离除以蛋白质的总长度。较高的接触序表示较长的折叠时间, 并且低接触阶数已被建议作为潜在下坡折叠或在没有自由能垒的情况下发生的蛋白质折叠的预测指标。CO模型的提出表明蛋白质的折叠速率主要由它的天然态结构 (native state) 所决定。一般来说, α螺旋蛋白要比β蛋白折叠得快,用CO的理论解释是因为α螺旋蛋白中含有大量的局部有效接触,所以有较低的CO值、较高的折叠速率。接触序的理论说明, 折叠成有效接触多的三维结构, 这样的蛋白质三维结构能量更稳定, 折叠速率快。

其中N是接触总数,Δ Si,j是序列分离,即在氨基酸残基i和j之间的序列差, L是蛋白质中的残基总数。对于单结构域蛋白质,接触序的值通常在 5% 到 25% 之间,较低的接触序主要属于螺旋蛋白质,较高的接触序属于具有高 β-片层含量的蛋白质。

蛋白质结构预测方法在预测具有低接触序的蛋白质结构方面更准确。这可能部分是因为低接触序的蛋白质往往很小,但可能是由于在最小化能量函数的全局优化过程中要考虑的可能的远程残基-残基相互作用的数量较少。与在实验确定的蛋白质结构中观察到的分布相比,即使是Rosetta方法等成功的结构预测方法也会过度产生低接触阶结构预测。

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大洞遗址位于中国贵州省盘县珠东乡十里坪村西,是一处旧石器时代遗址,1996年被列为第四批全国重点文物保护单位。

大洞是一个喀斯特溶洞,实测长度共1660米,平面上主要由大洞洞厅、关牛洞、水洞、阴河坡和消洞五条洞道组成。垂直方向上关牛洞为最上层,第二层水洞和阴河坡,大洞洞厅为第三层,消洞为第四层,第五层为消洞的地下暗河,各层之间有竖井、陡坎相通。洞厅均宽35米,纵深220米,面积达8000平方米。

1990年6月,参加旅游资源考察的六盘水市文物工作者在大洞拾到了加工规整的石制品和动物化石数十件,材料送到中国科学院古脊椎动物与古人类研究所,次年该所派人前来考察, 认定这是一个有发掘和研究价值的古遗址。1992年4月14日,由中科院古脊椎动物与古人类研究所、贵州师范大学地理系、六盘水市文管会、盘县特区文化局共同组成的考察队进驻大洞进行地质地貌考察和考古试掘。试掘清理面积约80平方米,出土石制品135件、动物完整牙化石800余枚、各种化石300多公斤。1993年4月至10月,联合考察队对大洞进行了正式发掘,揭露面积12平方米,出土石制品700余件、哺乳动物化石500余件。

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文须雀(学名:Panurus biarmicus)为鹟科文须雀属的鸟类。分布于英格兰、法国、比利时、荷兰、丹麦、德国、瑞士、西班牙、意大利、波兰、匈牙利、土耳其、伊朗、前苏联、摩洛哥以及中国大陆的新疆、青海、甘肃、内蒙古、东北、河北等地,一般生活于在水边杨、柳树的枝叶间和芦苇的顶端。该物种的模式产地在欧洲Holstein。

* 文须雀北亚亚种(学名:Panurus biarmicus russicus)。分布于中国大陆的新疆、青海、甘肃、内蒙古、东北、河北等地。该物种的模式产地在前苏联。

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