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有多达16％的pre-miRNA可以透过核RNA编辑改变，其中最常见地，如腺苷脱氨酶作用于RNA（ADAR）上的腺苷至肌苷（A至I）转换。另外，RNA编辑也能停止核加工(例如pri-miR-142，其会导致核糖核酸酶Tudor-SN的降解)，并改变下游流程包括细胞质miRNA的加工与目标专一性(像是改变中枢神经系统中miR-376的种子区域)。
核细胞穿梭蛋白Exportin-5涉及前miRNA发夹从细胞核输出的过程。这种蛋白质是karyopherin家族的一个成员，它会识别前miRNA发夹的3'末端，由RNase III酶与Drosha遗留的两个核苷酸的突出端。 Exportin-5-mediated介导运输到细胞质是能量依赖的(主动运输)，其使用GTP来绑定Ran蛋白。
在细胞质中，前miRNA发夹会被由RNaseIII酶Dicer所切割 ，该内切核糖核酸酶与miRNA发夹的5'和3'端相互作用并切除连接3'和5'臂的环 ，产生长度为22个核苷酸的不完全的miRNA：miRNA*双链体 。整个发夹长度和环尺寸都会影响Dicer的加工效率。由于RNA的不完全配对性质，miRNA：miRNA*双链体的配对程度也会影响切割 。
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