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在计算生物学中,N50和L50是Contigs(重叠群)或脚手架长度的统计值。N50的计算方式类似于平均值或中位数,但是对长Contigs的权重更大。这种方法广泛运用于序列组装中,特别是在参考组装草稿内的Contigs长度中。这种度量常被用来描述基因组装配(有时还有其他装配)的“完整性”。但它的本质是告诉你一些关于Contigs长度分布的信息。
N50根据连续性定义装配质量。按照序列长度的顺序排列你的集合中的所有Contigs。首先是最长的Contigs,然后是第二长的Contigs,最后是最短的Contigs。然后,从一开始累加所有Contigs的长度,这样您就可以得到最长的Contigs+第二长的Contigs+第三长的Contigs,以此类推,直到达到占总装配长度50%的数字,即为N50。N50可以近似的看作分布质量一半的点:比N50长的所有Contigs的碱基数于比N50短的所有Contigs的碱基数在数值上是接近的。
L50定义为,在给定一组Contigs的情况下,长度总和占基因组大小一半的最小Contigs数。
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相关阅读:N50、L50和相关统计学
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汉延陵是西汉孝成皇帝刘骜的陵寝,位于陕西省咸阳市周陵乡严家沟村。
陵寝始建于建始元年闰正月,鸿嘉元年(前20年),成帝又新修昌陵。五年后废弃昌陵,最终安葬于延陵。延陵的陵园平面近方形,东西长382米,南北长400米。墓形如覆斗,底边长173米,顶部边长51米,高31米。
汉成帝后妃中,有马婕妤姐妹葬于延陵的记录。另有许皇后、班婕妤二位后妃葬于延陵附近的记录,具体所在已无法考证。延陵陪葬墓园内共有五排十五座墓葬,十一座封土尚存,其中第一排第1座封土最为高大。此墓以许皇后陵之名列入文物保护单位,但有观点认为,依西汉惯例,帝陵陪葬区安葬的是皇室、外戚、重臣,此墓并非许皇后陵。延陵东北部有两座大型墓葬,北面一座被认为是班婕妤墓。另有观点认为,南面一座为秦惠文王的公陵,北面一座是秦公夫人墓葬。陵东有薛宣等7座陪葬墓。
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