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目前已知的粟酒裂殖酵母株系超过160种，见于多种酒精饮料中，康普茶中也有发现粟酒裂殖酵母。
分子种系发生学研究显示在子囊菌门的演化树中，粟酒裂殖酵母所在的演化支位于较基部的位置，酿酒酵母则位于较深处，与后者相比，粟酒裂殖酵母和两者的共祖较相似，酿酒酵母则累积了较多的演化变异，例如酿酒酵母已失去了超过300个粟酒裂殖酵母与动物共有的基因，而粟酒裂殖酵母只失去了179个酿酒酵母与动物共有的基因。截至2015年，PomBase纪录粟酒裂殖酵母编码蛋白质的基因有5054个（酿酒酵母则有5821个，但此数目受旁系同源物与酿酒酵母在演化上经历过两次基因组重复事件的影响）。粟酒裂殖酵母的基因组长约13.8Mb，与酿酒酵母的12.5Mb接近，但前者只有3个染色体（分别长5.7、4.6与3.5Mb），后者则有16个较小的染色体，其中最大者仅长1.5Mb。另外粟酒裂殖酵母染色体的中节和动物的较为相似，许多两者中节共有的蛋白皆不见于酿酒酵母。
粟酒裂殖酵母一般仅进行无性生殖，但养分缺乏的逆境可促使其交配而进行有性生殖；此外过氧化氢处理（造成氧化压力以破坏DNA）或以其他方式造成DNA位点突变亦可引发其交配，显示DNA损伤可能诱发此真菌进行有性生殖以修补DNA。
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