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清华大学化学系现有两个教育部重点实验室：“生命有机磷化学及化学生物学教育部重点实验室”和“有机光电子与分子工程教育部重点实验室”。
清华大学分析中心设在化学系。分析中心拥有透射电镜（TEM）、扫描电镜（SEM）、扫描俄歇探针仪（AES）、X射线光电子能谱仪（XPS）、等离子体发射光谱仪（ICP）、傅里叶变换红外多联机光谱仪（Mic/GC/Raman/FTIR）、激光拉曼光谱仪（LRS）、顺磁共振波谱仪（ESR）、600兆核磁共振波谱仪（NMR）、色质联用仪（GC-MS）、液质联用仪（LC-MS）、高效液相色谱仪（HPLC）、X射线荧光光谱仪（XRF）以及紫外、原子吸收光谱仪等大型分析仪器。化学系还有国家级实验室北京电子能谱中心。
* 杨石先（1938年-1945年）（西南联合大学化学系系主任）
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三对角矩阵算法（tridiagonal matrix algorithm），又称为托马斯算法（Thomas algorithm，名称源于英国数学家Llewellyn Thomas）是数值线性代数中的一种算法，通过简化形式的高斯消元法求解三对角矩阵。包含n个未知数的三对角方程组可以写成
高斯消去法在求解一般线性方程组时需要时间复杂度，但对于三对角系统则只需复杂度。
三对角矩阵算法可分为如下两步进行。第一步求解系数和：
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鲁迅在《中国小说史略》中称，刘鹗的《老残游记》、李宝嘉的《官场现形记》、吴趼人的《二十年目睹之怪现状》和曾朴的《孽海花》为「晚清四大谴责小说」。
胡适说：「这一段写唱书的音韵，是很大胆的尝试。音乐只能听，不容易用文字写出，所以不能不用许多具体的物事来作譬喻。白居易（《琵琶行》）、欧阳修（《秋声赋》）、苏轼（赤壁赋》）都用过这个法子。」「刘鹗先生在这一段里连用了七八种不同的譬喻，用新鲜的文字、明了的印象，使读者从这些逼人的印象里，感觉那无形象的音乐的妙处。这一次的尝试总算是很成功的了。」
《老残游记》是一时兴起，不经意而成的作品。美籍华人夏志清认为「从刘鹗在《老残游记》中所表现出的艺术才能来看，不是不会撰述面面俱圆的故事，而是他不满前人以情节为中心的小说，又有野心包揽更高更繁杂的完整性，以与他个人对国计民生的看法互相呼应」；又说：「《老残游记》文如其题，是主人翁所视、所思、所言、所行的第三人称的游记，这游记对布局或多或少是漫不经心的，又钟意貌属枝节或有始无终的事情，使它大类于现代的抒情小说，而不似任何型态的传统中国小说。」，结论《老残游记》是「近乎革命式的成就」。
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