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DEAD box家族的蛋白多为RNA解旋酶,参与转录、RNA剪接、ribosome biogenesis、RNA转运、转译与RNA降解等细胞中的多种RNA相关反应。
酿酒酵母mRNA剪接的过程有Sub2、Prp28与Prp5等3种DEAD box蛋白参与,其中Prp5可与U2 spliceosomal RNA结合以影响其结构,使其得以与mRNA内含子中的分支位点(branchpoint)结合;Prp28可能可识别内含子的5′端切割位点,但此蛋白无解旋酶活性。另外Prp2、Prp16、Prp22、Prp43与Brr213等多种DEAH家族蛋白也参与mRNA剪切。
转译起始因子eIF4A为一DEAD box蛋白,在转译起始时可解开mRNA5′ UTR的二级结构,以利核糖体小次单元扫描mRNA以寻找起始密码子。另一DEAD box Ded1也参与转译起始过程,但具体机制仍不明;还有一与Ded1相似的DEAD box蛋白Vasa可与eIF2互动。
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