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菌丝圈是真菌和植物用来交换养分的场所,菌根提供来自土壤的养分而植物提供光合作用的糖类。杜鹃花菌根具有产生酵素来分解复杂有机物的能力,这让一些菌根具有腐生能力,能取得有机上的营养,例如氮,这些矿物元素在杜鹃花科植物生长的环境是十分缺乏的。
目前对杜鹃花菌根主要的生理功能研究在于Rhizoscyphus ericae所分离下来的型态鉴定,Rhizoscyphus ericae原属于囊菌刚的柔膜菌目,但现在归类在Pezoloma 。除了Rhizoscyphus ericae外,目前可以培养子囊菌类的杜鹃花菌根有Meliniomyces (似Rhizoscyphus ericae), Cairneyella variabilis, Gamarada debralockiae和Oidiodendron maius 。DNA定序分析揭露了杜鹃花根系的真菌族群多样性,但有可能包含其他非菌根真菌、腐生菌或寄生菌。
除了子囊菌类外,亦有一些担子菌类锈革孔菌目的杜鹃花菌根,但无法培养
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