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《德臣西报》开办初期为下午出版的周报。1867年,德臣为了跟香港另外两份主要报章《孖剌西报》和《Hong Kong Register》竞争,停办周报,并把该报的分支《晚报》改为日报继续出版。其早期社址位于威灵顿街近安庆台的右边,并设有自己的印刷工场。1878年2月1日,收购了《香港晚邮报及船期纪录报》,改为发行晚刊日报李谷城(2000), 香港报业百年沧桑, 明报出版社:香港。
《德臣西报》在1845年至1858年间主要刊登商业广告、政府宪报以及传教士和专家撰写的文章,新闻报导是完全被忽略的。该报早期被社会人士批评为亲政府的报章,但其实在港督般咸任内和之后的一段时间,该报也有披露一些政府的丑闻。1850年,德臣就曾在报纸上刊登殖民地政府的弊端与腐败的调查。他直至离职前,一直都以维护香港华人的利益,和反对澳门进行华工贸易而普遍受到华人的欢迎的。
1972年,香港电视广播集团在南华早报手上购入该报60%股权,并将其四开小报格式改回两开大报,然而到最后在1974年宣布停刊。《德臣西报》便成为了无线电视至今唯一曾营办的报纸。
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蛋白质的接触序是蛋白质天然状态三级结构中氨基酸间接触位置的量度。它计算方法为折叠蛋白质中形成天然接触的残基之间的平均序列距离除以蛋白质的总长度。较高的接触序表示较长的折叠时间, 并且低接触阶数已被建议作为潜在下坡折叠或在没有自由能垒的情况下发生的蛋白质折叠的预测指标。CO模型的提出表明蛋白质的折叠速率主要由它的天然态结构 (native state) 所决定。一般来说, α螺旋蛋白要比β蛋白折叠得快,用CO的理论解释是因为α螺旋蛋白中含有大量的局部有效接触,所以有较低的CO值、较高的折叠速率。接触序的理论说明, 折叠成有效接触多的三维结构, 这样的蛋白质三维结构能量更稳定, 折叠速率快。
其中N是接触总数,Δ Si,j是序列分离,即在氨基酸残基i和j之间的序列差, L是蛋白质中的残基总数。对于单结构域蛋白质,接触序的值通常在 5% 到 25% 之间,较低的接触序主要属于螺旋蛋白质,较高的接触序属于具有高 β-片层含量的蛋白质。
蛋白质结构预测方法在预测具有低接触序的蛋白质结构方面更准确。这可能部分是因为低接触序的蛋白质往往很小,但可能是由于在最小化能量函数的全局优化过程中要考虑的可能的远程残基-残基相互作用的数量较少。与在实验确定的蛋白质结构中观察到的分布相比,即使是Rosetta方法等成功的结构预测方法也会过度产生低接触阶结构预测。
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