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染色质免疫沉淀-测序(ChIP-sequencing,简称为ChIP-seq)被用于分析蛋白质与DNA的交互作用。该技术将染色质免疫沉淀(ChIP)与大规模并行DNA测序结合起来以鉴定与DNA相关蛋白的结合部位。其可被用于精确绘制任意目的蛋白在全基因组上的结合位点。在此之前,ChIP-on-chip是研究这些蛋白-DNA联系的最常用的技术。
ChIP-seq主要用于确定转录因子和其他染色质相关蛋白质如何影响表型影响机制。确定蛋白质如何与DNA相互作用来调控基因表达对于充分了解许多生物过程和疾病状态至关重要。这种表观遗传信息与基因型和表达分析是互补的。 ChIP-seq技术目前主要被看作是需要杂交阵列的ChIP-on-Chip的替代品。 这必然会引入一些偏差,因为一个阵列仅限于有固定数量的探针。相反,尽管不同测序技术的测序偏差尚未完全了解,测序被认为偏差较小。
与转录因子和其他蛋白质直接物理相互作用的特定DNA位点可通过染色质免疫沉淀被分离出来。 ChIP产生在活体内In vivo兴趣蛋白质结合的目标DNA位点文库。 大规模平行序列分析与全基因组序列数据库结合使用来分析任何蛋白质与DNA的相互作用模式或任何表观遗传染色质修饰的模式。 这可以应用于一系列ChIP蛋白和修饰,如转录因子,聚合酶和转录机制,结构蛋白质,蛋白修饰和DNA修饰。 作为对特异性抗体依赖性的替代方法,已经开发了不同的方法来发现基因组中所有核小体耗尽的(nucleosome-depleted)或核小体扰动(nucleosome-disrupted)的活性调控区的超集,如DNase-Seq和FAIRE-Seq。
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相关阅读:染色质免疫沉淀-测序
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目前已知受汉他病毒感染的黑带森鼠(Apodemus agrarius.)、棉鼠Cotton Rat(Sigmodon hispidus)、鹿鼠 Deer Mouse(Peromyscus maniculatus)、稻大鼠Rice Rat (Oryzomys palustris)和美国白足鼠White-footed mouse(Peromyscus leucopus),会将汉他病毒传播给人。
已被汉他病毒(Hantavirus)感染的啮齿类动物将病毒传播给人。感染的潜伏期约二至三星期。患者因血管内皮细胞出现病变而引起多样症状,如因血管通透性增加出现低血压性休克及出血性症状。因应感染病毒的品种,患者可出现肾综合征出血热 (HFRS) 或汉他病毒肺综合征(HPS),并出现不同的症状。
潜伏期一般是12~16天,但最长可达2个月,后突然急性发高烧且持续3~8天、出现结膜充血、虚弱、背痛、头痛、腹痛、厌食及呕吐等症状。出血发生在第3~6天,接著出现蛋白尿、低血压或休克。轻微肾病变,但亦可能恶化至急性肾衰竭,且维持数周。死亡率约1-15% (首尔品种、汉他品种和多布拉瓦品种)和 <1%(普马拉品种)。存活者多于在数周至数月内肺功能恢复正常,少数有肺功能缺损之后遗症。
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Giulio Camillo所注记的《歌本》(梵蒂冈宗座图书馆藏,1501年)
《歌本》(意大利文:Il Canzoniere,英文:Song Book),又称《薄雾集》或《雾凇稀疏》(意大利文:Rime Sparse),但最初的题目为《Rerum vulgarium fragmenta》。是一本诗集,由意大利诗人、人文主义作家法兰西斯科·佩脱拉克编辑而成。
1327年,一位名为劳拉的女士在亚维侬的圣克莱教堂(Sainte-Claire)出演 Rime sparse(“离散的旋律”)的身影,激起了他持续很久的创作冲动。于是,他写了366首诗,其中大部分为十四行诗,占317首。后来的那些沿袭他风格的文艺复兴诗人把这366首诗的合集称为《歌本》。虽然佩脱拉克常用拉丁文写作,并认为意大利语用于吟诗作文还不够成熟,但《歌本》的语言却使用意大利市井常用的白话。
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