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假结结构(pseudoknot)是一类RNA三级结构。假结结构包含至少两个茎环结构。其中,一个茎环结构的茎的一半插入了另一个茎环结构的茎结构中。假结结构最初于1982年在Turnip yellow mosaic virus中发现。假结结构折叠成类似于绳结的三维结构,但却并不是真正的拓扑学的结。
假结结构很难被计算生物学的检测手段查出,因为其对所在环境相当敏感,且具有「重叠的」本质。假结结构的碱基对的嵌入较差,即碱基对与其他的碱基对有一定重叠。这使得通过标准的动态规划方法对RNA序列中可能存在的假结结构的预测变得更加困难。动态规划通过一个递推记分系统来确认配对的茎结构,因而很难测出非嵌入的碱基对。更新的随机上下文无关文法也面临相同的问题。因此,像 Mfold和 Pfold这样的流行的二级结构预测方法并不能预测出目标序列中的假结结构。它们只能确认更稳定的假结结构中的两个茎。
可以通过动态规划的方法确认某些类型的假结结构,但这类方法不够详尽,而且在作为序列长度的函数时与进行与假结无关的算法时测量表现较差。一个困扰许多预测最低的自由能的方法的问题是NP完全。
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* 战争没有女人的脸(戦争は女の颜をしていない,监修:速水螺旋人)
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病史记录表明,大多数狂犬病人的死亡都是由暂时性大脑机能紊乱所导致的,而大脑本身受累较小,甚至根本没有损伤。根据这一经验,威洛比的小组设计了一种狂犬病的实验性治疗方法。吉西的父母同意在威斯康辛儿童医院进行实验性治疗。威洛比医生的目标是使吉西进入诱导昏迷状态,保护她的身体机能免受大脑的损害,以期使她能存活较长的时间,从而让她的免疫系统可以有足够的时间来产生抗体对抗病毒。吉西被给以氯胺酮(Ketamine)、咪达唑仑(midazolam) 和苯巴比妥(Phenobarbital)组成的复方药物以抑制大脑活动,并在等待她的免疫系统产生抗体以抗击病毒的过程中给以抗病毒药物:利巴韦林(Ribavirin)和金刚烷胺(amantadine)。6天后,当免疫系统的进展有明显的迹象时,吉西从昏迷中被唤醒。
住院31天后,吉西身上所有病毒宣告清除,并解除隔离。最初有一些关于她的大脑受损的担忧,但是虽然她的大脑是受到了一定的损伤,但是疾病以及治疗似乎对她的认知能力几乎没有造成损害。她用了几个星期的时间进行康复治疗,并于2005年1月1日出院。到2005年初,她已经能自主走路及重返校园,并开始驾驶机动车。马约诊所的神经学家肯尼斯·马克(Kenneth Mack)医生这样描述她进入大学时的状况:她恢复得“非常好”,并将会继续好转。
在密尔沃基疗法下吉西康复的原因仍在争议中。虽然疗法看起来是像计划的那样起效了,但是她的医生认为吉西感染的可能是狂犬病病毒中特别弱的突变型,或者是由于她被咬的地方远离大脑,令她特别强劲的免疫系统能有足够的时间来对抗病毒。当她入院时,从她体内提取不出活的病毒,而只能提取出抗体,并且那只蝙蝠也没有被收回进行测试。
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