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浦江建置始于东汉兴平二年(195)析太末、诸暨所置丰安县,属会稽郡,隋灭陈后废。唐天宝十三载(754)又析义乌、兰溪及富阳置浦阳县,属婺州,五代吴越国天宝三年(910)改名浦江县,沿用至今。唐天宝年间置浦阳县后始筑土城,明正德七年(1512)立东西南北四座城门,嘉靖二年(1523)又设十八座栅门,嘉靖三十六年(1557)为防倭寇改筑石城,万历三十八年(1610)向北拓展,崇祯十一年(1638)、清乾隆三十三年至三十四年(1768-1769)重修。1949年后至1958年12月前后相继拆除。2017年底至2018年初重建大东门迎春门,施工期间曾发现古城墙遗址。
浦江城墙南临浦阳江(南江),西临西溪,隔溪对伏蟾山,东临东溪,隔溪对东山和龙峰山(塔山)。唐代土城周一里(约576米),高一丈三尺(约4.16米)。明清石城城周五里一百二十步(约3072米),仍高一丈三尺(约4.16米),厚与高同,呈不规则形,设有陆门八座,水门一座,八座陆门分别为大东门迎春门、大西门咸宁门、大南门文明门、大北门望华门(旧又名仙华门,其名称取自城北仙华山,以上为正门,建城楼俱三间)、小东门拥青门、小西门凝爽门、小南门宣和门和小北门辅辰门(以上为偏门,建城楼俱一间),水门名祈年门(建城楼一间),位于城西南隅。城外利用东溪、西溪和浦阳江为天险,不另设城壕(图)。
城内原主要街道呈一横三纵的格局,其中横街称为东街——横街——西街——小桥头(今解放路),连接大东门和大西门,居中的纵街称为上大街——下大街(今和平路),连接大南门与县署,与横街交汇处称四牌楼,东侧的纵街称为后街(今民主路),与横街交汇处称玉案头。原主要建筑有县署(位于城北正中,抗战时期被侵华日军拆毁)、城守署(驻防署,位于东街北侧)、学宫(浦江县学文庙,位于城东南,南临大方池(学塘),其址今为浦江县政府(老县府))、浦阳书院及文昌阁(位于学宫东侧,南临大方池(学塘),池中建有钟楼,其址今为浦江县政府(新县府))、城隍庙(位于学宫西南,其址今为时代广场)、白佛寺(位于城隍庙西侧,其址今为文化广场)、天后宫(位于白佛寺西侧,其址今为文化广场)和太极宫(位于县署东南)等,今已不存。城内尚存解放路和民主路和等传统历史街区,以及张氏宗祠(今浦江博物馆)和严家廿四间头(今浦江县非遗馆)具有代表性的传统宗祠、民居。
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染色质免疫沉淀-测序(ChIP-sequencing,简称为ChIP-seq)被用于分析蛋白质与DNA的交互作用。该技术将染色质免疫沉淀(ChIP)与大规模并行DNA测序结合起来以鉴定与DNA相关蛋白的结合部位。其可被用于精确绘制任意目的蛋白在全基因组上的结合位点。在此之前,ChIP-on-chip是研究这些蛋白-DNA联系的最常用的技术。
ChIP-seq主要用于确定转录因子和其他染色质相关蛋白质如何影响表型影响机制。确定蛋白质如何与DNA相互作用来调控基因表达对于充分了解许多生物过程和疾病状态至关重要。这种表观遗传信息与基因型和表达分析是互补的。 ChIP-seq技术目前主要被看作是需要杂交阵列的ChIP-on-Chip的替代品。 这必然会引入一些偏差,因为一个阵列仅限于有固定数量的探针。相反,尽管不同测序技术的测序偏差尚未完全了解,测序被认为偏差较小。
与转录因子和其他蛋白质直接物理相互作用的特定DNA位点可通过染色质免疫沉淀被分离出来。 ChIP产生在活体内In vivo兴趣蛋白质结合的目标DNA位点文库。 大规模平行序列分析与全基因组序列数据库结合使用来分析任何蛋白质与DNA的相互作用模式或任何表观遗传染色质修饰的模式。 这可以应用于一系列ChIP蛋白和修饰,如转录因子,聚合酶和转录机制,结构蛋白质,蛋白修饰和DNA修饰。 作为对特异性抗体依赖性的替代方法,已经开发了不同的方法来发现基因组中所有核小体耗尽的(nucleosome-depleted)或核小体扰动(nucleosome-disrupted)的活性调控区的超集,如DNase-Seq和FAIRE-Seq。
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