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更新于 2026-10-09

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染色质免疫沉淀-测序(ChIP-sequencing,简称为ChIP-seq)被用于分析蛋白质与DNA的交互作用。该技术将染色质免疫沉淀(ChIP)与大规模并行DNA测序结合起来以鉴定与DNA相关蛋白的结合部位。其可被用于精确绘制任意目的蛋白在全基因组上的结合位点。在此之前,ChIP-on-chip是研究这些蛋白-DNA联系的最常用的技术。

ChIP-seq主要用于确定转录因子和其他染色质相关蛋白质如何影响表型影响机制。确定蛋白质如何与DNA相互作用来调控基因表达对于充分了解许多生物过程和疾病状态至关重要。这种表观遗传信息与基因型和表达分析是互补的。 ChIP-seq技术目前主要被看作是需要杂交阵列的ChIP-on-Chip的替代品。 这必然会引入一些偏差,因为一个阵列仅限于有固定数量的探针。相反,尽管不同测序技术的测序偏差尚未完全了解,测序被认为偏差较小。

与转录因子和其他蛋白质直接物理相互作用的特定DNA位点可通过染色质免疫沉淀被分离出来。 ChIP产生在活体内In vivo兴趣蛋白质结合的目标DNA位点文库。 大规模平行序列分析与全基因组序列数据库结合使用来分析任何蛋白质与DNA的相互作用模式或任何表观遗传染色质修饰的模式。 这可以应用于一系列ChIP蛋白和修饰,如转录因子,聚合酶和转录机制,结构蛋白质,蛋白修饰和DNA修饰。 作为对特异性抗体依赖性的替代方法,已经开发了不同的方法来发现基因组中所有核小体耗尽的(nucleosome-depleted)或核小体扰动(nucleosome-disrupted)的活性调控区的超集,如DNase-Seq和FAIRE-Seq。

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相关阅读:染色质免疫沉淀-测序

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茂兰瘰螈(学名:Paramesotriton maolanensis),一种分布于中华人民共和国贵州茂兰国家级自然保护区的两栖动物,隶属于蝾螈科瘰螈属。

成年雄螈体长177.4~192毫米,成年雌螈体长197.4~207.8毫米,是瘰螈属中体型最大的一种。身体皮肤相对光滑,无颗粒状疣。背部枕骨到尾端具有一条浅黄色背鳍褶。通体呈棕黑色,腹部具有不规则橙红色大斑点和较小的黄色斑点。掌底部表面白皙。

本种正模采集自贵州省荔波县境内的茂兰自然保护区。

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模式种是E. yahnahpin,最初于1994年被描述、命名时,被归类于迷惑龙属的一个种(Apatosaurus yahnahpin)。种名来自于当地达科塔语的词汇「mah-koo yah-nah-pin」,意指印地安人的某种胸部服装,因为这些化石的胸部骨头排列方式,类似这种胸部服装。。

正模标本(边号TATE-001)是一个相当完整的颅后身体骨骼,发现于怀俄明州的莫里逊组下层。之后发现的一些零碎化石,也被归类于这个种。

但在1998年,罗伯特·巴克(Robert T. Bakker)的重新研究,发现牠是更为原始的物种,所以巴克将牠命名为原雷龙,学名的意思是「最初的雷龙」。巴克在命名时,将原雷龙归类于梁龙科的迷惑龙亚科。

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