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Sigal等人在蛋白质水平上观察到了变异性。似乎通常比上述研究中在mRNA水平上观察到的要小得多，而且mRNA的分布更严重地倾斜。如何解决这种差异？一个答案可能是方法论上的：通过筛选表达可检测量的YFP的细胞，由Sigal等人获得的具有YFP插入的蛋白质。 GAPDH mRNA的可变性要比其他基因低，这可能支持偏重于或组成性表达较低变异性的基因。蛋白质稳定性也可能在mRNA与蛋白质变异性之间的关系中起作用。寿命短的蛋白质将非常紧密地跟踪mRNA水平，从而导致类似于mRNA分布（并与之密切相关）的蛋白质分布。但是，如果蛋白质降解缓慢（如YFP的情况），那么大量的较旧蛋白质将缓冲mRNA的快速波动。也就是说，mRNA爆发可能仅用于“补充”蛋白质水平。在这种情况下，mRNA和蛋白质水平没有强烈的相关性。

在存在正反馈的情况下，噪声会导致更加剧烈的行为。正反馈可以充当开关，其中来自给定基因的少量表达可以用来进一步激活基因本身的表达，最终将基因从“关闭”状态翻转为“开启”状态。但是，在存在协同作用的情况下，细胞可以无限期地保持在“关闭”状态，因为协同作用会创建一个阈值，该阈值要求蛋白质水平必须超过该阈值才能触发反馈。在那种情况下，基因表达的偶然大波动可以起到随机激活开关并将细胞推入开启状态的作用在具有正反馈开关的合成系统中已经观察到这种双稳态表达模式以及几种天然存在的遗传正反馈回路。

使用随机基因表达来创建多种表型是很明显的原理，因为病毒、细菌和酵母的同基因种群不能以任何其他方式表现出异质性。但是，在许多高等真核生物中，种群多样性主要来自遗传和环境多样性，这使得利用随机基因表达的论据不太合理。例如，在研究中，人们会想象确定性地执行开发程序对于生产功能性组织至关重要，因为机体间的差异反映了遗传差异，而不是随机差异。然而即使研究过程中，研究人员也发现了许多与随机基因表达有关的随机细胞命运决定的有趣例子。

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