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科赫出生在德国小城克劳斯塔尔,父亲为矿业官员。科赫从小就热爱生物学,7岁那年,一位牧师因病去世了,科赫在去悼念的路上不断问著母亲:「牧师得了什么病?」、「绝症治不好吗?」母亲当时无法回答他的问题,也奠定了他将来从医的志向。
1862年,科赫以极高的科学及数学成绩从高中毕业,19岁进入格丁根大学学习科学,3个学期后,科赫转向学习医学。科赫在医学院念书的第5个学期,参与Jakob Henle(Jakob Henle)的肾神经结构研究。亨勒是「组织学」的先驱,主要的贡献是经由显微镜观察的解剖学,他甚至是最早提出「病原体传染致病」假说的几个人之一。科赫在第6个学期开始研究琥珀酸,并此为毕业论文,1866年1月,科赫以极为优秀的成绩从医学院毕业。
科赫师从德国著名病理学家Rudolf Carl Virchow学习化学技术。累积几年临床工作经验后,于1870年自愿从军参加普法战争,在沃尔什滕小镇担任区域医疗官。当时,炭疽病(Anthrax)在他所驻扎地区的农场家畜中广为流行。早在1850年,法国医师Casimir Davaine(Casimir Davaine)等人已经成功分离出炭疽杆菌,但尚未证明这就是造成炭疽病的元凶。
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