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植物研究所以整合植物生物学为学科定位，以植物对环境适应的生物学基础为主要研究方向,以绿色高效农业和生态环境的国家需求为重要研究领域，重点在植物系统发育重建和进化、陆地植被/生态系统与全球变化、资源植物分子与发育生物学、植物信号转导与代谢组学、生物多样性保育与可持续利用等方面开展系统的研究。
1950年，由静生生物调查所（1928年建立）植物部和北平研究院植物研究所（1929年建立）合并为中国科学院植物分类研究所，1953年改名为中国科学院植物研究所。植物所老所址基本上延续的是北平研究院植物研究所的所址（今位于北京市西城区西直门外大街141号），包括来远楼（今动物园西北角）和“黄房”（今动物园长颈鹿馆西）及陆谟克堂，现原址仍保存有西城区文物保护单位-陆谟克堂（为纪念生物学家拉马克所建，位于北京动物园内），对面为中国科学院古脊椎动物与古人类研究所。自80年代开始，植物所办公和科研逐渐迁往位于海淀区香山附近的植物园，1995年完全搬迁至现所址。
2013年，陆谟克堂及西外大街137号院整体移交给古脊椎所，不再隶属于植物所管理。移交后，古脊椎所将陆谟克堂修缮改建，成为该所的所史馆。
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* 明命（1820年－1841年）：阮朝—阮圣祖阮福晈之年号
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