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Ozbudak（2002）观察到枯草芽孢杆菌中由诱导型启动子驱动的GFP表达基因表达的变异性取决于转录和翻译的潜在生化速率。在这些实验中，通过改变诱导水平来控制转录速率，并通过将突变引入核糖体结合位点来改变翻译速率。这验证了他们已经开发出的内在噪声随机理论，该理论预测了当这些参数改变时基因表达中的噪声将如何变化。尤其是，该理论预测，噪声（通过蛋白质表达水平的标准偏差除以均值来衡量）将反过来取决于转录速率，而不取决于翻译速率。这是因为蛋白质是由单个转录本以翻译“爆发”形式产生的；基因表达爆发的概念在当前的研究中继续发挥重要作用，尤其是在高等真核生物中。
在细菌中进行这些实验之后，研究人员开始研究真核生物中的随机基因表达，最初的研究重点是酵母。几乎立即，有几篇报道似乎表明，酵母中基因表达变异的来源在许多重要方面与细菌中有所不同。这些研究都检查了平均表达水平与该平均值变化之间的关系。但是，这些观察结果与转录爆发模型兼容，在该模型中，基因本身在转录活性和非活性状态之间随机过渡。除了在转录和翻译中的随机事件外，这种转录爆发模型还增加了随机性的另一个重要来源，目前已在理论上进行了详细的分析。需要这样的模型来解释真核数据，而不是大多数原核数据，强烈暗示某些特定于真核生物的基因表达调节剂是负责任的。最可能的候选方法是染色质重塑：当周围的染色质处于开放的乙酰化状态时，该基因能够相对自由地转录，而当染色质处于浓缩状态时，转录受到抑制。
在酵母中，基因表达中的噪声主要来自外部，导致不同基因之间的相关波动。迄今为止，识别出的这种外部噪声的来源是细胞大小，常见上游因子的变化和染色体位置；相比之下，原核基因表达的外在变异被认为主要源于上游因子的变异。
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