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TOP2是发生在胞质溶胶中的蛋白水解活性的一部分。在拟南芥中，该酶通过分解5到17个氨基酸残基之间的肽，在对氧化应激的反应和氧化蛋白质的降解中发挥作用。
水杨酸，被认为是一种酚类化合物，参与植物内的不同生物过程。这种化合物与其他激素一起有助于生长和发育调节。此外，它们也可以维持植物免疫反应。为了对抗病原体攻击和压力，水杨酸信号激活模式触发免疫（PTI）、效应触发免疫 (ETI）和细胞程序性死亡（PCD）。TOP1和TOP2已显示出与水杨酸相互作用并介导系统中水杨酸活性的能力。体外实验表明，当这些酶缺失或有缺陷时，对于病原体感染的脆弱性更高。
TOP蛋白水解活性受其单体/二聚体关系的影响。氧化环境会增加二聚体形式并导致蛋白水解活性抑制，同时减少环境，刺激单体积累，然后有利于TOP酶活性。在压力条件下，活性氧类（ROS）的产生增加，对光合作用和PCD造成损害。TOP酶可以调解这种不利条件的反应。TOP1可以调节抗氧化酶向叶绿体的输入。这些抗氧化酶可降低细胞器内的ROS水平。也有人提出看法指TOP1可以输入能够催化水杨酸合成的酶。另一方面，TOP2能控制胞质溶胶中对PCD很重要的信号肽的数量。氧化损伤，例如镉 （Cd2+）压力将会会产生氧化蛋白质，必须将其去除以防止细胞进一步受损。而TOP2有助于降解这些受损蛋白质。该酶通过针对在压力期间暴露的氨基酸残基来降解肽。
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